Estimación del riesgo poligénico de cáncer de mama en Galicia
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http://hdl.handle.net/10347/24843
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Título: | Estimación del riesgo poligénico de cáncer de mama en Galicia |
Autor/a: | Sobrino Robelo, Olalla |
Dirección/Titoría: | Carracedo Álvarez, Ángel (dir.) Gago Domínguez, Manuela |
Centro/Departamento: | Universidade de Santiago de Compostela. Facultade de Medicina e Odontoloxía |
Palabras chave: | Breast cancer | Cancro de mama | Cáncer de mama | Riesgo poligénico | Risco polixénico | |
Data: | 2020-07 |
Resumo: | El cáncer de mama constituye el tumor maligno más frecuente en las mujeres de todo el mundo. A pesar de la reducción considerable de su mortalidad a 5 años (<20%) asociada al gran avance de las técnicas de diagnóstico precoz y terapéuticas, este tumor sigue siendo un importante problema en la salud de la población que requiere atención focalizada.
Hoy en día sabemos que existen factores epidemiológicos que predisponen al desarrollo de cáncer de mama, así como alteraciones a nivel genético que también aumentan su riesgo. Dentro de estas alteraciones genéticas, las que parecen tener gran relevancia a nivel poblacional son los polimorfismos de nucleótido único o SNPs, cuyo efecto individual es despreciable, pero se torna multiplicativo cuando presentados de forma conjunta, pudiendo llegar a explicar cerca del 20% de la heredabilidad del cáncer de mama.
El objetivo de esta investigación fue analizar la frecuencia de los SNPs que más contribuyen al desarrollo del cáncer de mama en la población gallega e investigar si su combinación en forma de puntuación de riesgo poligénico (PRS) ayuda a estratificar a las mujeres según su riesgo de padecer cáncer de mama. A este efecto se diseñó con el software de Agena Bioscience un panel de SNPs a partir de 77 SNPs de riesgo definidos por Mavaddat et al. en 2015 y se analizó por medio de la tecnología de espectrometría de masas MALDI-TOF su presencia en la población gallega a través de la cohorte BREOGAN. La posible asociación entre los SNPs y el riesgo de cáncer de mama fue valorada utilizando riesgos relativos (OR) e intervalos de confianza del 95% derivados de modelos de regresión logística, ajustados por edad y lugar de estudio. Para evaluar su efecto combinado, creamos un score de riesgo poligénico ponderado para cada participante del estudio, resultado del sumatorio del número de alelos de riesgo de cada SNP multiplicado por el peso de ese SNP (escala logarítmica del OR por alelo derivado). Breast cancer is the most frequent malignant tumor in women worldwide. Despite the considerable decrease in its 5-year mortality rate (<20%) associated with the constant improvement of early diagnostic and therapeutic techniques, this tumor continues to be a major problem for the population’s health that requires focused attention. Nowadays we know that there are epidemiological factors that predispose to the development of breast cancer, as well as alterations at a genetic level that also increase its risk. Among these genetic alterations, the ones that seem to have the most relevance at a population level are the single nucleotide polymorphisms or SNPs, whose individual effect is disregardable, but becomes multiplicative when presented together, and may explain about 20% of the heritability of breast cancer. The aim of this research was to analyse the frequency of the SNPs that contribute most to the appearance of breast cancer in the Galician population and to investigate whether their combination in the form of a polygenic risk score (PRS) helps to stratify women according to their risk of suffering from breast cancer. To this effect, a panel of SNPs was designed with the Agena Bioscience software based on 77 risk SNPs defined by Mavaddat et al. in 2015 and their presence in the Galician population was analysed using the MALDI-TOF mass spectrometry technology through the BREOGAN cohort. The possible association between SNPs and breast cancer risk was assessed using odds ratios (OR) and 95% confidence intervals derived from logistic regression models, adjusted by age and place of study. To evaluate their combined effect, we created a weighted polygenic risk score for each study participant, resulting from the addition of the number of risk alleles of each SNP multiplied by the weight of the same SNP (logarithmic scale of the OR by derived allele). O cancro de mama constitúe o tumor maligno máis frecuente nas mulleres de todo o mundo. A pesar da redución considerable da súa mortalidade a 5 anos (<20%) asociada ao gran avance das técnicas de diagnóstico precoz e terapéuticas, este tumor segue sendo un importante problema na saúde da poboación que require atención focalizada. Hoxe en día sabemos que existen factores epidemiolóxicos que predispoñen ao desenvolvemento de cancro de mama, así como alteracións a nivel xenético que tamén aumentan o seu risco. Dentro destas alteracións xenéticas, as que parecen ter gran relevancia a nivel poboacional son os polimorfismos de nucleótido único ou SNPs, cuxo efecto individual é despreciable, pero tórnase multiplicativo cando presentados de forma conxunta, podendo chegar a explicar preto do 20% da herdanza do cancro de mama. O obxectivo desta investigación foi analizar a frecuencia dos SNPs que máis contribúen ao desenvolvemento do cancro de mama na poboación galega e investigar se a súa combinación en forma de puntuación de risco polixénico (PRS) axuda a estratificar ás mulleres segundo o seu risco de padecer cancro de mama. A este efecto deseñouse co software de Agena Bioscience un panel de SNPs a partir de 77 SNPs de risco definidos por Mavaddat et al. en 2015 e analizouse por medio da tecnoloxía de espectrometría de masas MALDI- TOF a súa presenza na poboación galega a través da cohorte BREOGAN. A posible asociación entre os SNPs e o risco de cancro de mama foi valorado utilizando riscos relativos (OR) e intervalos de confianza do 95% derivados de modelos de regresión loxística, axustados por idade e lugar de estudo. Para avaliar o seu efecto combinado, creamos un score de risco polixénico ponderado para cada participante do estudo, resultado do sumatorio do número de alelos de risco de cada SNP multiplicado polo peso dese SNP (escala logarítmica do OR por alelo derivado). |
Descrición: | Traballo de Fin de Grao en Medicina. Curso 2019-2020. |
URI: | http://hdl.handle.net/10347/24843 |
Dereitos: | Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional |
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- Grao en Medicina [334]
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